Detto procedimento autocertificato, della durata di 45/60 giorni nel quale il SUAP riceve l'istanza corredata da autocertificazioni attestanti la conformità del progetto alle norme vigenti redatte da professionisti abilitati e sottoscritte dal legale rappresentante. Copia della documentazione viene trasmessa a cura del SUAP agli uffici competenti per le verifiche. Allo scadere del termine, qualora gli uffici non si siano espressi, le verifiche si intendono concluse positivamente per silenzio assenso.
Procedimento mediante conferenza di servizi: qualora il progetto presentato risulti in contrasto con lo strumento urbanistico, il responsabile del procedimento rigetta l'istanza e può avviare la procedura per la formazione di una proposta di variante allo strumento urbanistico generale con l'indizione di una conferenza di servizi. Questa procedura, prevista dall'art. 5 del D.P.R. n. 447/1998, comporta l'approvazione di uno specifico progetto in variante allo strumento urbanistico. Il piano resta invariato e viene approvato il progetto, pur in contrasto con esso: la variante vale esclusivamente per quel determinato impianto produttivo. Alla conferenza di servizi partecipano oltre agli uffici comunali aventi competenza in merito all'adozione della variante, tra i quali lo Sportello Unico per l'Edilizia ed il Settore Pianificazione Urbanistica Generale, la Provincia di Milano, le altre amministrazioni competenti per l'approvazione del progetto (ASL, ARPA, VVF, MM, ecc.) ed ogni altro soggetto portatore di interessi, rispetto al progetto da esaminare. Tutte le amministrazioni partecipanti alla conferenza esprimono il parere di competenza e il verbale della conferenza, in caso di esito favorevole, costituisce proposta di adozione della variante urbanistica e viene trasmesso al Consiglio Comunale per l'approvazione.